明朝初年曾是歸德侯府和漢王府。清朝為江寧織造署、江南總督署、兩江總督署。清朝康熙、乾隆皇帝下江南時(shí)均以此為“行宮”。1911年10月辛亥革命爆發(fā)后，1912年1月1日，孫中山在此處宣誓就任中華民國(guó)臨時(shí)大總統(tǒng)，并組建了中國(guó)歷史上第一個(gè)共和制的國(guó)家政權(quán) ── 中華民國(guó)臨時(shí)政府。1949年4月23日，人民解放軍解放南京，攻占總統(tǒng)府。從此，揭開了中國(guó)歷史新的一頁(yè)。

南京解放后的近50年中，總統(tǒng)府一直作為機(jī)關(guān)的辦公場(chǎng)所。自20世紀(jì)80年代以來(lái)，機(jī)關(guān)單位陸續(xù)搬遷，并于1998年在總統(tǒng)府舊址之上，開始籌建南京中國(guó)近代史博物館。經(jīng)過(guò)精心的規(guī)劃和五年的建設(shè)，至2003年已初具規(guī)模。目前，博物館總占地面積為9萬(wàn)平方米，共分三個(gè)參觀區(qū)域。中區(qū)（中軸線）主要是國(guó)民政府、總統(tǒng)府及所屬機(jī)構(gòu)；西區(qū)是孫中山的臨時(shí)大總統(tǒng)辦公室、秘書處和西花園，以及參謀本部等；東區(qū)主要是行政院舊址、馬廄和東花園。一系列展館和史料陳列，則分布在這三個(gè)區(qū)域中。

明朝初年為漢王府花園，以漢王朱高煦名中的“煦”字而得名。清朝為兩江總督署花園。太平天國(guó)建天朝宮殿時(shí)予以擴(kuò)建。因花園位于宮殿西側(cè)，又稱“西花園”，與東花園相對(duì)稱。清軍破城時(shí)被毀，曾國(guó)藩予以重建。1912年1月，中華民國(guó)臨時(shí)政府成立，孫中山的臨時(shí)大總統(tǒng)辦公室和起居室就在煦園內(nèi)。以后，又先后作為南京留守府、江蘇都督府、督軍署等機(jī)構(gòu)的辦公處。1927年4月國(guó)民政府成立后，國(guó)民革命軍總司令部、軍委會(huì)，以及總統(tǒng)府軍務(wù)局等機(jī)構(gòu)，都曾在園內(nèi)設(shè)有辦公處。煦園為典型的江南園林，與總統(tǒng)府連為一體。有諸多著名的遺址景點(diǎn)，如石舫、夕佳樓、忘飛閣、漪瀾閣、印心石屋等。

總統(tǒng)府建筑于民國(guó)元年六月一日開工興建，至民國(guó)八年三月竣工，整棟建筑物是以正大門入口小樓為基礎(chǔ)，一層一層緊密相連，結(jié)構(gòu)嚴(yán)謹(jǐn)，造型對(duì)稱，設(shè)計(jì)精細(xì)?？偨y(tǒng)府內(nèi)隨處可見高聳的圓柱，雅致的雕飾，深邃的回廊，精巧的拱門，充分表現(xiàn)歐洲文藝復(fù)興時(shí)期巴洛克式之建筑特色。第二次世界大戰(zhàn)末期，曾遭受轟炸，嚴(yán)重毀損，民國(guó)三十四年臺(tái)灣光復(fù)后，于次年重修完成，當(dāng)時(shí)為慶祝蔣公六秩華誕，改稱介壽館，民國(guó)三十八年中央政府播遷來(lái)臺(tái)后，便以此館作為總統(tǒng)府，沿用迄今。

“子超樓”是總統(tǒng)府的主要建筑，位于總統(tǒng)府中軸線北端。這幢辦公大樓是在國(guó)民政府主席林森任上所建。林森字子超，且任國(guó)民政府主席時(shí)間最長(zhǎng)，所以人們習(xí)慣稱之為“子超樓”。該樓于1934年開工，至1935年12月竣工?！白映瑯恰敝黧w五層，局部六層。第一層，先為國(guó)民政府文官處，后成為總統(tǒng)府文書局的辦公室。第二層是總統(tǒng)、副總統(tǒng)辦公室。朝南的這間是蔣介石的辦公室，朝北的這間是副總統(tǒng)李宗仁的辦公室。第三層是國(guó)民政府會(huì)議室。

20世紀(jì)初期，南京的一些建筑受西方折衷主義建筑思潮影響，都爭(zhēng)相效仿西方建筑形式，并以此為榮。這幢黃色西洋式平房是典型的仿意大利文藝復(fù)興式樣，始建于清量將在大端方任上，竣工于末任總督張人駿。因位置在總督署的西面，故又稱西花廳。整幢建筑坐北朝南，七開間。1912年1月以后成為中華民國(guó)臨時(shí)大總統(tǒng)辦公室。